Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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