Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms