Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK1Q08629 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK1Q08629 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms