Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NRG1Q02297 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms