Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPIBQ01892 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPIBQ01892 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms