Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD4P55036 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms