Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPAP38571 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIPAP38571 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIPAP38571 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIPAP38571 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIPAP38571 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms