Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GGCXP38435 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GGCXP38435 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms