Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms