Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms