Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA4P25789 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA4P25789 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms