Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYF6P23409 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MYF6P23409 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MYF6P23409 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYF6P23409 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms