Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC192P0DO97 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms