Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F6O75461 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F6O75461 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms