Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

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Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA1GO43497 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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