Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLOCKO15516 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms