Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms