Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIPSLA2A3N6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms