Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP11Q9Y3A2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms