Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms