Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms