Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms