Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG3Q96JB2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms