Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C16orf54Q6UWD8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms