Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN3Q5MJ09 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms