Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL22Q53GT1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms