Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms