Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EDRF1Q3B7T1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms