Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms