Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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