Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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