Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGCGQ13326 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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