Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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