Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRISP1P54107 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms