Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGM4P49221 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TGM4P49221 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms