Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms