Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB7P09629 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB7P09629 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB7P09629 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB7P09629 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB7P09629 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms