Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF254O75437 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF254O75437 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms