Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F8W031 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F8W031 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
F8W031 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
F8W031 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms