Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN25C9JDP6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CLDN25C9JDP6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN25C9JDP6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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