Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EMC9Q9Y3B6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms