Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLCO1B3Q9NPD5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms