Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSPO3Q9BXY4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms