Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP400Q96L91 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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