Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATL2Q8NHH9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATL2Q8NHH9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms