Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms