Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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