Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SKP1P63208 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKP1P63208 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKP1P63208 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKP1P63208 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms