Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms