Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms